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■ ザフト水陸両用編

 ZGMF-1017 ジン
 YF-3A ジンフェムウス(プロトグーン)
 グーンの試験機で、極小のウロコを振動させて水中を自在に移動するシステム、スケイル・モーターの実験機でもある。
 この機体によって得られたデータが、後の水中用MSの開発に活かされることとなった。
■UWMF/S-1 ジンワスプ 《→ ジン編


 UMF-4A グーン
 ザフト軍の開発した水中戦用MS。イカのようなフォルムをしている。
 水中航行時には、巡航モードに変形することで、高速で移動する事が出来る。
■UMF-4A グーンから派生する機体

 UTA/TE-6 グーン地中機動試験評価タイプ
 グーンに地中での行動能力を持たせた試作機。
 機体上半分の装甲表面にはスケイル・モーターが埋め込まれ、それを発動する事で周囲の土壌、岩盤を粉砕・液状化させ、機体の周囲に推力を発生させる。その他、地中での行動のために通常のセンサー類の他に、地中レーダーと音響探査機を装備している。3機が建造されたものの、実用性が低く、運用も困難を極めたため、運用コストに見合うメリットが得られるとは言い難かった。そのため、実戦投入の予定はなかったが、アラスカ戦役で大きく戦力を失ったザフトは、パナマ攻略の際に、武装強化を施した本機を投入し、投入した3機とも、無事に生還している。
主なパイロット:ディラー・ロッホ
 UTA/TE-6P ジオグーン
 UTA/TE-6「グーン地中機動試験評価タイプ」の量産機。
 オーブ攻略戦に投入され、海中からそのまま地中へと潜り、オーブ国防司令部を攻略した。
 スーパーグーン
 UMF-5 ゾノ
 ザフト軍の開発した水中戦用MS。
 グーンよりも格闘能力が向上しており、その両腕のクローで敵機を攻撃する。
主なパイロット:マルコ・モラシム